Biopolimery a polimery syntetyczne Metodyka badań biopolimerów Wiązania chemiczne w biopolimerach Siły van der Waalsa Wiązania wodorowe Rola wiązania wodorowego w biopolimerach Oddziaływania donorowo-akceptorowe (koordynacyjne) Oddziaływania stackingowe Oddziaływania jonowe Oddziaływania jon–dipol Transport elektronów w układach biologicznych Konformacje strukturalne Konformacja chiralna Konformacja helikalna (spiralna) Woda w strukturach biopolimerów Struktura fizyczna wody Oddziaływanie wody z biopolimerami Otoczka hydratacyjna Wiązanie wody przez peptydy Oddziaływania hydrofilowe Oddziaływania hydrofobowe Oddziaływanie międzycząsteczkowe w roztworach Rozpuszczanie biopolimerów Roztwory i jednostki stężeń Termodynamiczne podstawy przebiegu reakcji biochemicznych Makrocząsteczka w roztworze Proces pęcznienia Kompleksy międzycząsteczkowe Asocjacja, aglomeracja i agregacja białek Agregacje makrocząsteczek Surfaktanty (detergenty) – środki pomocnicze Błony komórkowe Biokoloidy Micele Pęcherzyki – micele wielowarstwowe Wilgoć Wilgotność względna i bezwzględna Właściwości higroskopijne biopolimerów Ekstrakcja Suszenie biopolimerów Metody suszenia Sita molekularne Przygotowywanie próbek do badań Oczyszczanie białek Wysalanie białek Denaturacja białek Procesy oksydacyjne biopolimerów Reakcje wolnych rodników z biopolimerami Nadtlenek wodoru Wychwyt rodnika tlenku azotu (.NO) Stres oksydacyjny Degradacja oksydacyjna biopolimerów tlenem molekularnym Mechanizmy działania antyutleniaczy Degradacja oksydacyjna biopolimerów tlenem singletowym Degradacja oksydacyjna biopolimerów tlenem atomowym Degradacja oksydacyjna biopolimerów ozonem Homeostaza Modyfikacja fizyczna i chemiczna biopolimerów – zagadnienia ogólne Niebezpieczne preparaty w badaniach z biopolimerami 2. CHROMATOGRAFICZNE METODY SEPARACJI I WYDZIELANIA BIOPOLIMERÓW Techniki separacyjne – chromatografia Chromatografia cienkowarstwowa Chromatografia powinowactwa Kolumnowa chromatografia cieczowa Klasyczna chromatografia HPLC Polimerowe adsorbenty porowate Metody rozwijania chromatogramu Chromatografia jonowymienna Jonity organiczne Wymiana jonowa na kolumnie Oznaczanie pojemności wymiennej Oznaczanie pęcznienia jonitów Chromatografia sitowa (wykluczenia) Chromatografia gazowa Wybór techniki chromatograficznej 3. ELEKTROFORETYCZNE METODY SEPARACJI I WYDZIELANIA BIOPOLIMERÓW Podstawy praktyczne elektroforezy Elektroforeza bibułowa Elektroforeza żelowa Nośniki żelowe . Rozdział elektroforetyczny białek Oznaczanie elektroforetyczne rodzaju białek w materiale biologicznym metodą Western blot Pozostałe metody elektroforetyczne Elektroforeza kapilarna Elektroforeza swobodna z przepływem elektrodynamicznym Przygotowywanie próbek do elektroforezy Wyznaczanie względnej masy cząsteczkowej białka za pomocą elektroferezy Elektroforetyczny rozdział białek i kwasów nukleinowych Test immunoenzymatyczny ELISA Znakowanie immunologiczne rozdzielonych białek FIZYKOCHEMICZNE METODY IDENTYFIKACJI STRUKTURY BIOPOLIMERÓW Wyznaczanie mas molowych metodami sedymentacyjnymi

Wyznaczanie mas molowych za pomocą pomiarów sedymentacyjnych Wyznaczanie mas molowych metodą pomiaru szybkości sedymentacji Aparatura do ultrawirowania Współczynnik sedymentacji Współczynnik dyfuzji Pomiar współczynnika dyfuzji Wyznaczanie mas cząsteczkowych metodą pomiaru równowagi sedymentacyjnej Wyznaczanie mas cząsteczkowych metodą pomiaru sedymentacji w gradiencie gęstości Wyznaczanie mas molowych metodą spektrometrii mas Mechanizm jonizacji Pomiar widm masowych Metody spektroskopowe badania biopolimerów Spektrometria absorpcyjna w zakresie widzialnym Widma elektronowe Podstawowe prawa spektroskopii UV/VIS Aparatura do pomiarów widm absorpcyjnych Spektroskopia absorpcyjna aminokwasów i białek Spektroskopia absorpcyjna kwasów nukleinowych Spektrofotometria emisyjna fluorescencji Podstawy spektroskopii emisyjnej Wygaszanie fluorescencji Bezpromieniste przeniesienie energii wzbudzenia Aparatura do pomiarów widm fluorescencji Spektroskopia emisyjna aminokwasów, białek i kwasów nukleinowych Znakowanie biopolimerów do badań spektroskopowych Zielona fluorescencja Widma emisyjne fluorescencji chlorofilu Efekt Kautsky’ego Fluorescencyjne badanie rozwijania i zwijania białek Metody badania szybkich reakcji w analizie przepływowej Zastosowanie dichroizmu w badaniach biopolimerów Dichroizm kołowy w badaniu struktury konformacyjnej białek Metody optyczne badania biopolimerów Dwójłomność Skręcalność optyczna Dyspersja skręcalności optycznej Metoda dynamicznego rozpraszania światła Małokątowe rozpraszanie światła (SALS) Spektrometria w podczerwieni (IR) Widma oscylacyjno-rotacyjne biopolimerów Pomiar widm absorpcyjnych w podczerwieni (IR) Przygotowywanie próbek biopolimerów do badań widm IR Widma spektrofotometrii wewnętrznego odbicia promieniowania IR Widma spektrofotometrii odbicia dyfuzyjnego Spektroskopia IR wiązania wodorowego Zastosowanie spektroskopii IR do badania deuterowanych biopolimerów Spektrofotometria absorpcyjna IR w świetle spolaryzowanym Spektroskopia IR w bliskiej podczerwieni Analiza i zastosowania widm IR w badaniach biopolimerów Badanie struktur polimerowych metodami spektroskopii Ramana Podstawy spektroskopii Ramana Pomiar widm Ramana Badanie biopolimerów za pomocą spektroskopii Ramana. Badanie struktur polimerowych metodami magnetycznego rezonansu jądrowego (NMR) Podstawy spektroskopii NMR Pomiar widm NMR biopolimerów Przesunięcie chemiczne Interpretacja widm NMR białek Spektroskopia 13C NMR białek Spektroskopia NMR w fazie stałej Dwuwymiarowa spektroskopia 2D-NMR Metoda chemicznie indukowanej dynamicznej polaryzacji jąder Spektroskopia elektronowego rezonansu jądrowego (EPR) w badaniach rodników Podstawy rezonansu jądrowego Pomiar rezonansu jądrowego Znakowanie spinowe Badanie rozwijania i zwijania białek za pomocą znaczników spinowych Krystalizacja peptydów i białek Podstawy krystalizacji Krystalizacja polipeptydów i białek Zagadnienia analizy krystalograficznej Metody rentgenograficzne badania morfologii biopolimerów Podstawy spektrometrii rentgenowskiej Analiza rentgenograficzna metodami WAXS i SAXS Bazy danych krystalograficznych Metody mikroskopowe Transmisyjna mikroskopia elektronowa Skaningowa mikroskopia elektronowa Skaningowa mikroskopia sił atomowych Badanie mechanicznego rozwijania białka metodą AFM